Управление делами АННИО «МИИГУ им. П.А. Столыпина» является самым крупным административным подразделением института как по количеству сотрудников, так и по количеству решаемых задач. Фактически управлением делами осуществляется полное организационное сопровождение всех видов деятельности, чем обусловлена структура управления.
С 10 февраля 2020 г. в структуре управления создан новый Планово-финансовый отдел, состоящий из значительной части сотрудников, ранее работавших в упраздненном Финансово-экономическом управлении (ФЭУ). Управление делами также осуществляет методическое сопровождение работы созданного 10 февраля 2020 г. Многофункционального центра (МФЦ) МИИГУ им. П.А. Столыпина.
Структура Управления делами:
Общий отдел
Отдел кадров
Первый отдел
Второй отдел
Планово-финансовый отдел